오늘은 지난번 RANTES를 공부하며 언급된 MAPK pathway에 대해 공부해보려 한다.
MAPK(Mitogen-activated protein kinase) pathway란?
먼저 MAPK(Mitogen-activated protein kinase)는 아미노산인 serine과 threonin에 특이적인 단백질 키나아제
(인산화 효소)이다. 이는 외부 자극을 다양한 세포 반응으로 전환해 준다.
MAPK 경로는 가장 오래된 신호 전달 경로 중 하나로, 진화 과정에서 많은 생리적 과정에 널리 사용되어 왔다.
모든 진핵세포는 여러 MAPK pathway를 가지고 있으며, 유전자 발현과 대사 및 세포사멸, 분화 등을 조절한다.
MAPK 구조
MAPK는 포유류에서 14개 정도가 발견되어 분류되었는데, 아래는 conventional & atypical MAPK에 대한 모식도이다.
출처 : Activation and Function of the MAPKs and Their Substrates, the MAPK-Activated Protein Kinases
Conventional(전형적) MAPK에는 extracellular signal-regulated kinases 1/2(ERK1/2), p38 isoforms(α, β, γ, δ), c-Jun amino (N)-terminal kinases 1/2/3(JNK1/2/3), ERK5가 있고,
Atypical(비정형) MAPK에는 특이한 특성을 가진 ERK3/4, ERK7, Nemo-like kinase(NLK)가 있다.
모식도의 Ser/Thr Kinase domain은 모든 MAPKs의 핵심 구성 요소로, N- 및 C-말단 영역에 의해 둘러싸여 있다.
일부 MAPK에는 transactivation domain(TAD), nuclear localization sequence(NLS), ERK3 & ERK4에서 보존된 영역(C34), Ala, His, and Glu이 풍부한 영역(AHQr) 등의 추가적 domain이 존재한다.
MAPK pathway
포유류에서 MAPK(Mitogen-activated protein kinases) pathway는 아래와 같이 세단계로 구성된다.
출처 : MAP Kinase Pathways
먼저 MAPKKK(MAPKK kinase)는 주로 외부 자극에 반응해 Ser/Thr kinase로 인산화나 Ras/Rho 계열의 small GTP-binding protein과 상호작용으로 활성화된다.
MAP3K의 활성화로 MAPKK(MAPK kinase)가 이어서 인산화/활성화되며, 이는 다시 MAPK를 활성화시키기 위해 kinase domain의 Thr-X-Tyr motif의 트레오닌과 티로신 잔기에 이중 인산화가 이루어진다.
비정형 MAPK pathway의 경우에는 위와 같이 세 단계가 아닌 구성이 있기도하고, motif가 다르거나 상호작용이 명확히 밝혀지지 않은 것들이 많다고 한다.
더 추가하고 싶은 내용은 Signaling cascades에 관한 것인데 바로 아래의 모식도다.
출처 : By Bubus12 - Own work, CC BY 3.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=23463933
MAPK와 MAP2K의 경우 상대적으로 단순한 인산화 메커니즘을 가진 반면, MAP3K는 아주 복잡한 기전을 가진다.
c-Raf , MEKK4 또는 MLK3 와 같이 잘 알려진 MAP3K 중 다수는 활성화를 위해 여러 단계를 거쳐야 한다.
이들은 보통 allosteric enzyme으로 이는 활성부위가 아닌 다른 자리에서 효소의 활성에 영향을 준다는 뜻이다.
- 세포에 자극이 없을 때, 대부분은 세포질에서 closed state를 유지한다.
- small G-proteins이 활성화되고, 적절한 lipids가 존재할 때, Raf는 세포막으로 이동하고, autoinhibitory를 열어 활성화 할 수 있게 준비한다. (이때가 활성화된 상태는 아니다.)
- Open된 Raf kinasedomain은 homo- 또는 heterodimer를 형성해 활성화시킨다.
- 이 dimer는 각각 인산화되어 완전히 활성화되고, 촉매(catalytic) 부위와 인산화된 활성화 루프가 잠긴다.
- 완전히 활성화된 Raf는 MAP2K를 인산화 시킬 수 있게 된다.
- 이후 인산화된 MAP2K가 MAPK를 인산화시키고, MAPK signaling cascade가 마무리된다.
다음은 더 세부적인 경로에 대해 공부해보겠다.
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